我校自1979年開(kāi)始招收培養(yǎng)研究生,，1981年被國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)批準(zhǔn)為全國(guó)首批碩士學(xué)位授權(quán)單位,，1998年被國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)批準(zhǔn)為博士學(xué)位授權(quán)單位,，并獲得普通外科學(xué)三級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)，2000年獲外科學(xué)二級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授權(quán),，2000年開(kāi)始臨床醫(yī)學(xué)碩士專(zhuān)業(yè)學(xué)位工作,，2004年開(kāi)始口腔醫(yī)學(xué)碩士專(zhuān)業(yè)學(xué)位工作，2009年開(kāi)始公共衛(wèi)生碩士專(zhuān)業(yè)學(xué)位工作,，2010年獲臨床醫(yī)學(xué)一級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授權(quán),，2014年獲應(yīng)用心理學(xué)、藥學(xué)和護(hù)理學(xué)專(zhuān)業(yè)學(xué)位點(diǎn)授權(quán),，2018年獲基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和藥學(xué)一級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授權(quán),、臨床醫(yī)學(xué)博士專(zhuān)業(yè)學(xué)位授權(quán)、醫(yī)學(xué)技術(shù)一級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán),，2021年獲公共衛(wèi)生和口腔醫(yī)學(xué)一級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授權(quán),、口腔醫(yī)學(xué)博士專(zhuān)業(yè)學(xué)位授權(quán)。目前,，我校有5個(gè)一級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)（基礎(chǔ)醫(yī)學(xué),、臨床醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué),、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué),、藥學(xué)）,，8個(gè)一級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)（生物學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué),、臨床醫(yī)學(xué),、口腔醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué),、藥學(xué),、護(hù)理學(xué)、醫(yī)學(xué)技術(shù)）,，2個(gè)博士專(zhuān)業(yè)學(xué)位授權(quán)點(diǎn)（臨床醫(yī)學(xué),、口腔醫(yī)學(xué)）,，6個(gè)碩士專(zhuān)業(yè)學(xué)位授權(quán)點(diǎn)（應(yīng)用心理,、臨床醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué),、公共衛(wèi)生,、護(hù)理、藥學(xué)）,，涵蓋理學(xué),、醫(yī)學(xué)、管理學(xué)等學(xué)科門(mén)類(lèi),。我校同時(shí)還還開(kāi)展同等學(xué)力申請(qǐng)碩士學(xué)位工作,。目前學(xué)校擁有省級(jí)研究生教育創(chuàng)新聯(lián)合培養(yǎng)基地3個(gè)，省級(jí)專(zhuān)業(yè)學(xué)位研究生聯(lián)合培養(yǎng)基地2個(gè),，二級(jí)研究生培養(yǎng)單位30個(gè),，有碩士研究生導(dǎo)師1141名，博士研究生導(dǎo)師276名,，在校研究生4000余人,。培養(yǎng)的萬(wàn)余名高級(jí)醫(yī)學(xué)人才扎根邊疆，服務(wù)基層,，為云南醫(yī)藥衛(wèi)生事業(yè)和經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展做出了卓越貢獻(xiàn),。

學(xué)校不斷深化學(xué)術(shù)學(xué)位和專(zhuān)業(yè)學(xué)位研究生培養(yǎng)模式改革。科教融合,，大力提升學(xué)術(shù)學(xué)位知識(shí)創(chuàng)新能力,；醫(yī)教融合著力培養(yǎng)專(zhuān)業(yè)學(xué)位研究生創(chuàng)實(shí)踐創(chuàng)新能力。逐步推進(jìn)臨床醫(yī)學(xué)博士專(zhuān)業(yè)學(xué)位研究生培養(yǎng)與專(zhuān)科醫(yī)師培訓(xùn)銜接,。全面實(shí)現(xiàn)臨床（口腔）醫(yī)學(xué)碩士專(zhuān)業(yè)學(xué)位研究生培養(yǎng)與住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)接軌,。以培養(yǎng)目標(biāo)和學(xué)位學(xué)位授予要求作為學(xué)校課程建設(shè)規(guī)劃的根本依據(jù)，增加跨學(xué)科類(lèi),、方法類(lèi),、研討類(lèi),、實(shí)踐類(lèi)課程。以一級(jí)學(xué)科學(xué)位授權(quán)點(diǎn)為單元開(kāi)發(fā)公共課程,，以研究方向及領(lǐng)域開(kāi)發(fā)專(zhuān)業(yè)課程,。加強(qiáng)信息技術(shù)手段在課程建設(shè)中的運(yùn)用，構(gòu)建線(xiàn)上線(xiàn)下共建的運(yùn)行模式,。與上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院,、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院阜外醫(yī)院等高水平院校建立了聯(lián)合培養(yǎng)機(jī)制。舉辦系列實(shí)踐和科研技能大賽,，榮獲首屆全國(guó)影像醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)研究生臨床能力展示賽一等獎(jiǎng),、多次在全國(guó)醫(yī)科院校研究生院聯(lián)盟研究生論壇、西部地區(qū)藥學(xué)研究生創(chuàng)新學(xué)術(shù)論壇上獲得佳績(jī),。